Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms