Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms