Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKLRP30613 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKLRP30613 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKLRP30613 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKLRP30613 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKLRP30613 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKLRP30613 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKLRP30613 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms