Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms