Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX2P28328 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX2P28328 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms