Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms