Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT1P21579 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT1P21579 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT1P21579 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms