Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms