Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms