Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms