Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms