Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms