Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATE1O95260 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATE1O95260 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATE1O95260 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATE1O95260 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms