Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPXO76031 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLPXO76031 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
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CLPXO76031 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPXO76031 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLPXO76031 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPXO76031 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLPXO76031 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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