Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms