Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPLO60437 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPLO60437 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPLO60437 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPLO60437 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms