Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms