Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms