Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF25A6NGN4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms