Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms