Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V9GYV3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V9GYV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V9GYV3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V9GYV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
V9GYV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
V9GYV3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
V9GYV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms