Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A4Q9Y6R1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms