Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms