Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED3Q9Y3Q3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED3Q9Y3Q3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms