Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMPQ9Y244 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMPQ9Y244 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMPQ9Y244 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms