Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML2Q9UQR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCML2Q9UQR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCML2Q9UQR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms