Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM33Q9UPN9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms