Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4Q9UP95 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms