Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFR2Q9UP52 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFR2Q9UP52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFR2Q9UP52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFR2Q9UP52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFR2Q9UP52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFR2Q9UP52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFR2Q9UP52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFR2Q9UP52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms