Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNW9

NOVA2, RNA-binding protein Nova-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA2Q9UNW9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOVA2Q9UNW9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOVA2Q9UNW9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOVA2Q9UNW9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms