Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP18Q9UMW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP18Q9UMW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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