Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF1Q9UMS5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms