Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATPIF1Q9UII2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATPIF1Q9UII2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATPIF1Q9UII2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms