Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRDQ9UH36 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRDQ9UH36 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SRRDQ9UH36 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms