Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DKK4Q9UBT3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK4Q9UBT3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms