Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms