Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN10Q9UBB4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN10Q9UBB4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms