Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A6Q9P2U8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms