Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL13Q9P2N7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms