Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCN3Q9P1Z3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HCN3Q9P1Z3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN3Q9P1Z3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms