Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRACLQ9P1F3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABRACLQ9P1F3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms