Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKIRAS1Q9NYS0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKIRAS1Q9NYS0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms