Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR4AQ9NXH8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOR4AQ9NXH8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms