Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf109Q9NX04 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf109Q9NX04 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms