Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX18Q9NVP1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms