Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2LQ9NUG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms