Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOMER3Q9NSC5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms