Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHPT1Q9NRX4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHPT1Q9NRX4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms