Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 413.1□□□□□ -0.318e-14■■■■■ 37
DROSHAQ9NRR4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.51e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.51e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.461e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-215ENST00000544010 848 ntTSL 230.18■■■□□ 2.421e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-207ENST00000539333 651 ntTSL 230.07■■■□□ 2.41e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-214ENST00000543243 552 ntTSL 228.28■■■□□ 2.121e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.111e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-211ENST00000541703 475 ntTSL 328.04■■■□□ 2.081e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-213ENST00000543131 539 ntTSL 328.04■■■□□ 2.081e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-202ENST00000538198 449 ntTSL 327.8■■■□□ 2.041e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.911e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 REXO2-205ENST00000539119 664 ntTSL 324.02■■□□□ 1.441e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.34e-18■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.281e-9■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.7□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 29.21□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 36.9
DROSHAQ9NRR4 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC8.65□□□□□ -1.031e-14■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.513e-11■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.51■■■□□ 2.473e-11■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 219.12■□□□□ 0.653e-11■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 217.96■□□□□ 0.473e-11■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 217.75■□□□□ 0.433e-11■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 515.2■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 36.8
DROSHAQ9NRR4 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 36.5
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 541.46■■■■■ 4.232e-6■■■■■ 36.5
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-216ENST00000583060 477 ntTSL 331.69■■■□□ 2.665e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-223ENST00000585299 537 ntTSL 425.79■■□□□ 1.725e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-215ENST00000582574 556 ntTSL 325.35■■□□□ 1.655e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-207ENST00000579481 564 ntTSL 224.93■■□□□ 1.585e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-221ENST00000585062 556 ntTSL 424.5■■□□□ 1.515e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-213ENST00000581441 552 ntTSL 419.93■□□□□ 0.785e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.015e-14■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 RETREG2-207ENST00000452293 609 ntTSL 439.87■■■■□ 3.976e-11■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)33.46■■■□□ 2.956e-11■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.566e-11■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 RETREG2-205ENST00000443757 558 ntTSL 423.83■■□□□ 1.416e-11■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 RETREG2-208ENST00000458520 992 ntTSL 319.48■□□□□ 0.716e-11■■■■■ 36.4
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-211ENST00000578907 1084 ntTSL 342.58■■■■■ 4.411e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-215ENST00000582529 1212 ntTSL 540.69■■■■■ 4.11e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-207ENST00000578176 937 ntTSL 540.05■■■■■ 41e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.218e-7■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-209ENST00000566090 708 ntTSL 232.73■■■□□ 2.831e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.714e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.594e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 530.87■■■□□ 2.538e-7■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.528e-7■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.484e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-210ENST00000566447 511 ntTSL 429.8■■■□□ 2.361e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-208ENST00000581645 1477 ntTSL 529.18■■■□□ 2.264e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-204ENST00000563821 2235 nt28.39■■■□□ 2.131e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.954e-6■■■■■ 36.3
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DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 226.04■■□□□ 1.768e-7■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-208ENST00000578264 1071 ntTSL 525.95■■□□□ 1.751e-8■■■■■ 36.3
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DROSHAQ9NRR4 G3BP2-205ENST00000502654 546 ntTSL 423.38■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-219ENST00000515457 560 ntTSL 423.38■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 NUBP2-213ENST00000568610 1480 ntTSL 522.54■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-203ENST00000504743 576 ntTSL 422.52■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 221.76■■□□□ 1.071e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-213ENST00000480339 762 ntTSL 219.7■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-218ENST00000513927 426 ntTSL 319.68■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 36.3
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DROSHAQ9NRR4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-204ENST00000499709 508 ntTSL 416.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-217ENST00000511868 573 ntTSL 215.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-209ENST00000507701 678 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-214ENST00000509561 559 ntTSL 412.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-216ENST00000511146 577 ntTSL 312.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-212ENST00000508510 554 ntTSL 59.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-213ENST00000509100 514 ntTSL 58.79□□□□□ -12e-6■■■■■ 36.3
DROSHAQ9NRR4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.165e-8■■■■■ 36.2
DROSHAQ9NRR4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.817e-7■■■■■ 36.2
DROSHAQ9NRR4 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.44■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 36.2
DROSHAQ9NRR4 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 36.2
DROSHAQ9NRR4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 36
DROSHAQ9NRR4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 36
DROSHAQ9NRR4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 36
DROSHAQ9NRR4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.047e-7■■■■■ 36
DROSHAQ9NRR4 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 36
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 35.9
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