Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO4Q9NRQ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO4Q9NRQ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms